汉朝开始，行政机构形成中央——州——郡——县模式。在郡设太守，二千石。太守相当于市长，但是，太守的权力很大，不是市长可以比的。
太守在太守府办公，府里掾吏与中央公府差不多。
有无害吏：秋冬时案讯诸囚；
郡上计吏：汇报郡一年的户口、垦田、钱谷、刑狱状况等情况。
功曹史，主选署功劳。
五官掾，署功曹及诸曹事。
五部督邮，代表太守督察县乡，宣达政令兼司法等。
曹掾一人。正门有亭长一人。
主记室史，主录记书，催期会。
阁下及诸曹各有书佐，干主文书。
边郡置农都尉，主屯田殖谷。
又置属国都尉，主蛮夷降者。
户曹主民户、祠祀、农桑。奏曹主奏议事。辞曹主辞讼事。法曹主邮驿科程事。尉曹主卒徒转运事。贼曹主盗贼事。决曹主罪法事。兵曹主兵事。金曹主货币、盐、铁事。仓曹主仓谷事。
正门亭长：管理府衙正门。三国魏、晋、南朝宋州郡县皆设,各一人,掌州郡县府门亭正门及纠仪、通报诸事,下设门吏、门卒若干。晋代县又有狱门亭长。
以上为太守府掾吏，太守可以自己任命辟用。
而郡丞，郡尉（又叫都尉。总一郡军事。光武帝刘秀开始废除。但是，边郡予以保留设置），太守长史等则有国家任命。