R的数据结构
R是面向对象的一门语言
- 向量 vector 数值型向量 numeric、字符型向量character
- 矩阵matrix
- 数据框data frame
- 因子 factor 不同的level 分类变量
- 列表 大熔炉
向量
- 赋值
"<-"或者"="
x<-c(1,2,3) #常用的向量定义写法，意为将x定义为由元素1，2，3组成的向量。
x<-(1:10) #从1-10之间所有的整数
x<-seq(1,10,by = 0.5) #1-10之间每隔0.5取一个数（注意这里是逗号不是分号）
x<-rep(1:3,times=2) #1-3 重复2次
每个函数的作用及主要参数要了解
查询方式
？+函数名 或者 help（函数名）
- 从向量中提取元素
先要了解数据结构 常用的几个函数
class()
dim()
str()
head()
View()
2.1 根据不同数据结构中的数据的位置
x[4] #第4个元素
x[-4] #排除法，除了第4个元素之外剩余的元素
x[2:4]第2到4个元素
x[-(2:4)]除了……
x[c(1,5)]第1个和第5个元素
2.2 根据逻辑判断或者值得大小
## == ,！==, %in%,>,<,max，min,......
x[x==10] #等于10的元素
x[x<0]
x[x %in% c(1,2,5)] #存在于向量c（1，2，5）中的元素
数据框
读取 注意分隔符 sep='' ''、","、''\t''
read.table(file = "huahua.txt",sep = "\t",header =T)
X<-read.csv("huahua.txt")
2.2 设置行名和列名
colnames(X) #查看列名
rownames(X) #查看行名
colnames(X)[1]<-"bioplanet"#第一列列名改名
2.3 数据框导出
write.table(X,file = "yu.txt",sep = ",",quote=F) #分隔符改为逗号,字符串由默认的带双引号改
2.4 变量的保存与重新加载
save.image(file="bioinfoplanet.RData") #保存当前所有变量
save(frame1,file="frame1.RData") #保存其中一个变量
load("frame1.RData") #再次使用RData时的加载命令
2.5 提取元素
X[x,y]#第x行第y列
X[x,]#第x行
X[,y]#第y列（横着写，这是不够懒也不够优秀却能存在的写法）
X[y] #第y列（竖着写，这是懒惰又优秀的写法）
X[a:b]#第a列到第b列
X[c(a,b)]#第a列和第b列
X$列名#也可以提取列
‘$’ 见钱眼开 行个方便 哈哈
2.6 直接使用数据框中的变量
2.6.1 attach用法
attach(c) #将数据框名添加到搜索环境中
plot(case,values)#作图时就只需输入列名(连$都不用了)
detach(c)#做完后将a删除出搜索环境
局限性：两个以上数据框的列名有冲突时，同时attach会报错。
2.6.2 with()函数
适用于当同名变量出现多次，避免程序定位错误的情况
这两个以后碰到再说吧